源流一
源于姬姓，出自春秋时期晋国献侯四世孙奚的封地，属于以封邑名称为氏。据史籍《元和氏纂》和《辞源》记载，春秋时期晋献侯的第四世孙奚，时为晋国大夫，受赐食邑于祁（今山西祁县古镇），以邑为氏，称祁奚。祁奚，字黄羊，晋国大夫。史籍记载，周简王姬夷二年（晋厉公姬寿曼十年，公元前570年），“祁奚请老”，可知时年祁奚至少在五十岁以上。其生年最晚也在晋灵公姬夷皋初年（公元前 620年）。祁奚“历事晋景、厉、悼、平四世（公元前599～前532年）”。那么，既便从晋平公姬彪继位初年（公元前 557年）算起，其享年应在六十岁以上。如果以晋平公卒年计，则可能有八十余岁，可谓长寿。在祁奚的后裔子孙中，多以先祖封邑名称为姓氏，称祁氏。晋国祁氏一族还有许多分支，如祁成氏、祈夜氏、祈射氏等，后皆省文简化为单姓祁氏，世代相传至今，史称祁氏正宗。

祁氏族人大多尊奉祁奚为得姓始祖。

源流二
源于姬姓，出自黄帝分封的原始姓氏，属于帝王赐姓为氏。据史籍《广韵》记载，黄帝共生有二十五子，他给其中的十四个儿子分封了十二个姓氏，其中就有祁氏，是最古早的姓氏之一。
这十二个姓氏是：姬、姞、酉、祁、己、滕、箴、荀、任、僖、嬽、依，为百姓之祖一。

源流三
源于伊祁氏，出自远古尧帝的后代，属于以先祖名字为氏。据史籍《姓氏考略》记载，帝尧伊祁氏，亦称伊耆氏。
上古时期“祁”与“耆”二字通义，因此在帝尧的后裔子孙中，很早即有祁氏、耆氏，后皆统一为祁氏，是非常古早的姓氏之一。

源流四
源于陶唐氏，据史籍《路史》记载，少昊之后裔中有祁氏，属于以谥号为氏。祁，在两周时期为一种谥号称谓。在史籍《左传•庄六年》中记载：“邓祁侯。谥法，经典不易曰祁。”古人称死抱着经典之制不放的人和现象为“祁”。邓侯认为自己是楚文王的舅公，外甥焉有攻打舅舅之事？结果外甥还就真的把舅舅的国家灭了，堪称“祁”人也。因此，楚文王给邓侯上的谥号即为“祁”，史称邓祁侯，以警后世。
邓祁侯的后裔子孙和邓国故民，多有以先王之谥号为姓氏者，称祁氏，世代相传至今。

源流五
源于姬姓，出自周朝时期官吏祁父之后，属于以官职称谓为氏。祁父，是《周礼》军制中掌管军事典制之重臣，一说是管理兵甲的司马。在西周军制中，主政不主兵的军事统领，称祁父，这在《史记•谥法》中有明确注释：“治典不杀，曰祁。”后世的历朝历代，将犯了重罪后而不判处死刑的罪犯称作“祁人、祁案”，即源出于此。
在祁父的后裔子孙中，有以先祖官职称谓为姓氏者，称祁氏。

源流六
源于姬姓，出自春秋时期卫国大夫石祁子之后，属于以先祖名字为氏。在石祁子的后裔子孙中，有以先祖名字为姓氏者，称祁氏、石氏，世代相传至今。

源流七
源于回族，属于汉化改姓为氏。回族祁氏，据考来自唐初进入中国，后于唐天宝十四年（公元755年）任大将军的古都白丁。古都白丁一族初在新安郡（今安徽祁门及江西婺源等地），北宋时迁至扬州，在历史文献《扬州府志》中有记载。后有族人以居地祁门为汉化姓氏者，即称祁氏至今。
回族祁氏族人，主要分布在江苏省、河南省、湖北省地区。

源流八
源于蒙古族，属于汉化改姓为氏。据史籍《清朝通志•氏族略•蒙古八旗姓》记载：
⑴.甘肃地区西宁（今青海西宁）的土司，以及碾伯（今青海乐都）的土司为蒙古族人，是元末明初归降明太祖朱元璋的蒙古驻军首领，被明太祖赐汉姓为祁氏，因西宁、碾伯，地处祁连山地区，属于取其驻地名称为氏。
⑵.据史籍《黑龙江志稿•氏族略》中记载，蒙古族都讷亨氏，亦称德赫氏，源出蒙古新巴尔虎毕喇尔部落，通古斯语为Duneheng，世居巴尔古（今俄罗斯贝加尔湖东部），后多冠汉姓为祁氏。
⑶.蒙古族道劳•道古森氏，源出蒙古“黄金家族”博尔济吉特氏，也就是孛尔只斤氏，是其氏族的一个分支，在明朝时期即已经冠汉姓为祁氏。
⑷.蒙古乞颜氏，源出蒙古最古老的部落乞颜部，在元、明时期皆已有冠汉姓为祁氏、齐氏、陈氏、秦氏等者。

源流九
源于满族，属于汉化改姓为氏。据史籍《清朝通志•氏族略•满洲八旗姓》记载：
⑴.满族奇德哩氏，满语为Cideri Hala，世居叶赫（今吉林梨树），后多冠汉姓为齐氏、祁氏。
⑵.满族奇塔喇氏，亦称奇特拉氏、祁他氏，满语为Citela Hala，世居瓦尔喀（今南自长白山、图门江以北，北自黑龙江下游乌扎拉地方以南，东至俄罗斯滨海地区南，包括赫席赫、鄂漠和苏鲁、佛讷赫托克索等地）、蜚优城（今吉林珲春三家子乡高丽城村）、乌苏里（今黑龙江乌苏里江流域）、松花江沿岸等地，后多冠汉姓为祁氏、齐氏。有人考证与喜塔喇氏为同姓异写。
⑶.满族喜塔喇氏，亦称奇塔喇氏、喜特勒那氏，满语为Sitara Hala，汉义“指甲”或“插孔雀翎的管”，世居尼雅满山（今辽宁新宾）、蜚优城（今吉林珲春三家子乡高丽城村）、果勒敏珊延阿林盖吉（今长白山地区）、佛克顺（今辽宁新宾）等地，多冠汉姓为祁氏、赵氏、图氏、祝氏、文氏、齐氏、孙氏、希氏、奚氏、喜氏、线氏等。

源流十
源于土家族，属于汉化改姓为氏。土家族祁嘎氏，在明朝时期的改土归流运动中，改汉姓为祁氏。

源流十一
源于其他少数民族，属于汉化改姓为氏。今彝族、保安族、东乡族等少数民族中，均有祁氏族人分布，其来源大多是在唐、宋、元、明、清时期中央政府推行的羁糜政策及改土归流运动中，流改为汉姓祁氏，世代相传至今。

祁氏是一个典型的多民族、多源流姓氏群体，在当今姓氏排行榜上名列第一百五十一位，人口约一百零五万八千余，占全国人口总数的0.066%左右。
祁姓发源于祁地，当时的祁地，几乎包括整个晋中平川。晋顷公十二年（前五一四年），祁奚之孙祁盈因罪被杀，食邑亦被没收，此后祁姓子孙散居晋地。三家分晋后，发源于祁地的祁姓在今山西、河北、河南等省散居开来。